随着2024最新影响因子的出炉Chinese Medical Journal(《中华医学杂志英文版》)可谓是稳定发挥,影响因子为7.5,想发表生信文章的老师们,不妨关注一下这个既被SCI核心版收录、又拥有百年历史的期刊。
作为国产SCI,其编委会成员90%以上都是中国学者,国人非常友好,每年中国作者载文量占比92.827%。期刊质量在线,审稿周期中规中矩,目前为中科院3区,JCR Q1区。最主要是目前对纯生信文章友好,这可不就更适合咱生信人了嘛!
那咱要想在这本期刊上投稿并发表需要怎么做呢?就请跟着小森一起来分析学习这篇IF6分+的非肿瘤生信分析文章吧~
该文章的作者主要采用:SVM-RFE算法、随机森林算法、LASSO算法和二元逻辑回归等4种机器学习算法,筛选关键枢纽基因并进行整合,随后取交集进行免疫浸润分析和单细胞分析,并结合单细胞测序(scRNA-seq)对常见差异表达基因进行富集及其功能相关性分析。
(不知道怎么提取创新点的老师可以扫码联系小森喔~)
研究背景
胸主动脉瘤(TAA)是一种致命的心血管疾病,其发病机制尚未明确。本研究旨在识别和验证TAA的诊断标志物,为开发预防和治疗该疾病的新方法提供坚实的理论基础。
研究方法
从基因表达综合(GEO)数据库中获取3个数据集的基因表达谱。使用R中的“limma”包鉴定差异表达基因(DEGs),采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、随机森林和二元逻辑回归分析筛选诊断标记基因。单样本基因集富集分析(ssGSEA)用于评估TAA中的免疫细胞浸润。
研究思路
首先进行数据处理和差异表达基因(DEG)筛选:从基因表达综合(GEO)数据库中获取3个数据集的基因表达谱。使用R中的“limma”包鉴定差异表达基因(DEGs),采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、随机森林和二元逻辑回归分析筛选诊断标记基因。单样本基因集富集分析(ssGSEA)用于评估TAA中的免疫细胞浸润。
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网络药理学和孟德尔随机化是两种在医学研究中具有重要应用价值的方法,它们的结合可以为研究带来更深入的洞察和更可靠的结论。网络药理学主要关注药物、靶点和疾病之间的复杂网络关系,通过构建和分析这些网络来揭示药物的作用机制和潜在靶点。而孟德尔随机化则利用遗传变异作为工具变量,来推断暴露因素与疾病结局之间的因果关系。
小森今天给大家带来的文章来自济宁市第一人民医院相关研究团队,主要就是通过网络药理学、单细胞RNA测序(scRNA - seq)和代谢组学相结合的策略,探究孤雌内酯(PTL)在乳腺癌(BC)中的疗效和治疗机制,发到了7分+喔,一起来看看它的亮点吧~
1. 多学科技术整合:该研究综合运用了网络药理学、单细胞RNA测序和代谢组学等多种前沿技术,从不同层面深入探讨了孤雌内酯(PTL)对乳腺癌的治疗作用及其机制,这种多学科的整合为全面理解药物的疗效提供了更丰富的视角。
2. 创新的研究思路:通过网络药理学确定PTL的治疗靶点和作用机制,再结合单细胞RNA测序和代谢组学进一步验证和深入探究,这种从宏观到微观的研究思路具有创新性,能够更系统地揭示PTL的作用机制。
3. 关键蛋白的揭示:研究明确了JNK蛋白在PTL治疗乳腺癌疗效中的关键作用,为进一步开发以JNK为靶点的治疗策略提供了理论基础。
4. 深入的机制探讨:论文不仅探讨了PTL对乳腺癌细胞增殖、凋亡的影响,还深入研究了其对细胞内ROS生成、JNK和FOXO1信号通路的激活以及免疫调节和代谢的影响,全面揭示了PTL发挥抗乳腺癌作用的机制。
5. 临床应用潜力:研究结果为PTL的临床应用提供了合理的指导,有望为乳腺癌的治疗带来新的突破,具有重要的临床应用潜力
6. 数据丰富可靠:研究中使用了大量的数据集和实验方法,包括基因表达谱分析、免疫浸润分析、单细胞分析、结合亲和分析、孟德尔随机化分析等,数据丰富且可靠,为结论的得出提供了坚实的支持。
总之,这篇论文的亮点在于其多学科技术的整合、创新的研究思路、关键蛋白的揭示、深入的机制探讨以及潜在的临床应用价值,为乳腺癌的治疗研究提供了新的见解和方向。(各位小伙伴们,发表到MR文章可谓是打开了全新的机遇之门啊!MR如今已经“火爆全场”想要先人一步?那就必须及早加入战局,无论是创新思路还是生物信息学分析,小森都能帮你登顶,期待着你的高水平论文!)
Pivotal role of JNK protein in the therapeutic efficacy of parthenolide against breast cancer: Novel and comprehensive evidences from network pharmacology, single-cell RNA sequencing and metabolomics
JNK蛋白在孤雌性内酯治疗乳腺癌疗效中的关键作用
题目:JNK蛋白在孤雌性内酯治疗乳腺癌疗效中的关键作用 期刊:INT J BIOL MACROMOL 日期:2024-09-05 影响因子:7.7 关键词:乳腺癌,网络药理学,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,代谢组学
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