随着2024最新影响因子的出炉Chinese Medical Journal(《中华医学杂志英文版》)可谓是稳定发挥,影响因子为7.5,想发表生信文章的老师们,不妨关注一下这个既被SCI核心版收录、又拥有百年历史的期刊。

       作为国产SCI,其编委会成员90%以上都是中国学者国人非常友好,每年中国作者载文量占比92.827%。期刊质量在线,审稿周期中规中矩,目前为中科院3区,JCR Q1区。最主要是目前对纯生信文章友好,这可不就更适合咱生信人了嘛!

 

       那咱要想在这本期刊上投稿并发表需要怎么做呢?就请跟着小森一起来分析学习这篇IF6分+的非肿瘤生信分析文章~



       该文章的作者主要采用:SVM-RFE算法、随机森林算法、LASSO算法和二元逻辑回归等4种机器学习算法筛选关键枢纽基因并进行整合,随后取交集进行免疫浸润分析和单细胞分析,并结合单细胞测序scRNA-seq)对常见差异表达基因进行富集及其功能相关性分析。

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研究背景

       胸主动脉瘤(TAA)是一种致命的心血管疾病,其发病机制尚未明确。本研究旨在识别和验证TAA的诊断标志物,为开发预防和治疗该疾病的新方法提供坚实的理论基础。


研究方法

       从基因表达综合(GEO)数据库中获取3数据集的基因表达谱。使用R中的“limma”包鉴定差异表达基因(DEGs),采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、随机森林和二元逻辑回归分析筛选诊断标记基因。单样本基因集富集分析(ssGSEA)用于评估TAA中的免疫细胞浸润。


研究思路


 

       首先进行数据处理和差异表达基因(DEG)筛选从基因表达综合(GEO)数据库中获取3数据集的基因表达谱。使用R中的“limma”包鉴定差异表达基因(DEGs),采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、随机森林和二元逻辑回归分析筛选诊断标记基因。单样本基因集富集分析(ssGSEA)用于评估TAA中的免疫细胞浸润。



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